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Le COVID19 pour les intelligents qui s'ignorent

Le COVID19 pour les intelligents qui s'ignorent

Tout ce que vous voulez savoir sur le covid19 sans jamais oser le demander

Articles avec #geneorf8covid19 catégorie

Publié le par M. E. DAVID
Publié dans : #Raoultcovid19, #mutationscovid19, #genomecovid19, #geneORF8covid19
Didier Raoult, the eminent infectious disease specialist

Didier Raoult, the eminent infectious disease specialist

Today is the lockdown release day in France, and after several beautiful sunny days, many of us find ourselves back to  greyness and rain. It is as if the weather has been in tune with the mood of the French people, who are called to return back to everyday life with all the stress and anxiety in this context of health crisis. 

I do not have a crystal ball, but the latest studies about the data of new cases, hospitalized people etc, are rather hopeful. Obviously, we will not be able to escape a few clusters (a set of people infected from a single carrier) because the virus is still circulating. However we are more prepared now to be able to test and isolate people carrying covid19, so we can recover to a more serene life.

On Tuesday May 05th, on his morning show, Guillaume Durand interviewed Professor Didier Raoult, the eminent infectious disease specialist. The Professor confirmed that we were nearing the end of the pandemic.

The global epidemic of covid19, he said, comes in the form of a bell curve that is a common shape for the curves of most respiratory infections.

All curves of new cases, whether in France, Europe or in the rest of the world, have much the same shape, with or without lockdown.

According to Professor Didier Raoult, the number of infected people presenting at the IHU of Marseille (University Hospital Institute) is decreasing in Marseille, as well as in France and the rest of the world. The second wave therefore seems unlikely to happen because the data does not go in this direction. All institutes around the world observe the same decrease with these types of bell curves.  

"For reasons that no one understands, epidemic diseases start, they become more and more contagious, then they become more and more serious, then they gradually decrease becoming less and less contagious." This can be observed for most epidemics. 

He has noticed that the virus is currently less contagious and therefore the risk of secondary contamination is now much lower than it was a month ago.

Let's check this assumption with the latest available scientific and medical data.
 

The virus is less contagious now than it was a month ago.

Professor Didier Raoult on Radio classique, the political guest

https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/

https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/

To understand this phenomenon, we will take a look at the analysis of the mutations observed and their consequences in the expression of the virus in correlation with the observed symptoms.

For those requiring a better understanding  of what I'm going to talk about, I invite you to read or reread beforehand my article on covid  19 and its mutations. As I mentioned in this article, coronaviruses mutate regularly. These mutations are occurring at a lower frequency than for influenza viruses but sufficient to see many mutants appear.

Since the first genome of Covid19 was decoded, another 17,000 genomes have been sequenced to date and shared on the GISAID site, some of which carry distinctive mutations. It can also happen that during its mutations some accidents occur, such as losses of certain parts of the genome or in rarer cases, additions. 

As of April 2020, 33 distinct strains could be counted with slightly different characteristics from the conventional strain. Scientists, observed, that one of the mutants had acquired the ability to produce a viral load 270 times greater than the ancestral strain. Other teams found deletions (loss of part of the genome) on other strains of SARS-CoV-2 virus.

Was there a phase of increased contagiousness and severity of the virus?

Unfortunately, we have seen an increase in contagiousness and severity of the symptoms of the virus when the wave hit hard the European countries and New York.

How can we explain that the most serious cases would have been observed in Europe and New York?

  • The strains that attacked New Yorkers came largely from Europe

We have seen a more deadly attack of the virus in Europe and New York, compared to the Asian countries, which were first affected. In an article of "The New York Times", two distinct groups of researchers who worked on genomes came to the same conclusion. Most cases of New York coronavirus did indeed come from Europe where the epidemic severely affected populations.

  • More aggressive strains that can spread faster

A genetic analysis conducted on a sample of 103 SARS-CoV-2 genomes, indicated that these viruses evolved into two main types (designated L and S). The S-form, the ancestral version accounted for 30% of the genomes studied, while the L-type strain accounted for about 70%. The scientists concluded that human intervention may have exerted a more severe selective pressure on type L, resulting in a more aggressive form which is able to spread faster.

Another study showed that most of the sub-strains whose mutations were on the ORF8 and ORF1a genes (coding for two proteins) were found in patients outside Wuhan.

As a reminder, there are small systems in our cells capable of translating the messages contained in our genetic material and producing proteins that are assemblages of small units called amino acids.

Europeans and New Yorkers would therefore have had more virulent strains than those circulating at the beginning of the epidemic in China.

What do we know about the previous SARS outbreak?  

In 2003, during the SARS outbreak (with the SARS-CoV virus), a bell curve was observed with acceleration and regression as Professor Raoult mentioned.

During the progression of this epidemic, a number of genetic variants appeared in the human population as a result of unavoidable genetic mutations.

A large proportion of these viruses had mutations or deletions of genetic material in the gene "ORF8" encoding the protein "ORF8". And these mutations or deletions were associated with a reduced ability of the virus to replicate.

Towards the end of the SARS outbreak in 2003, genome sequences from viruses taken from the last infected patients were free of the gene encoding "ORF8", the latter having been removed from the genetic material of the original virus. This deletion may be associated with some form of host adaptation.

The same type of phenomenon has also been observed for batCoV (bats' SARS-CoV) viruses, with a similar disappearance of this fraction of the genome encoding for the protein "ORF8".

In a Chinese study, conducted on 63 samples (isolates) of SARS-CoV, the researchers noted major variations in the region of the viral genome where the ORF8 gene is located and also observed a correlation between the different phases of the epidemic and the different variations observed in this region of the genome.

They identified three phases:

The early phase: the first appearance period of SARS when the ORF8 gene was present.

The intermediate phase where mutations or deletions of more or less long nucleotide sequences were observed in the area of the ORF8 gene.

And the late phase where the ORF8 gene had completely disappeared from the genome, which seems to have signed the end of the SARS epidemic due to SARS-CoV.

During this human SARS outbreak, the removal of a fragment of the genome of 29 nucleotides from the ORF8 region appears to have occurred rapidly. Several mutants from Hong Kong patients have also seen a deletion of 386 nucleotides in the same region of the genome in some patients.

SARS-CoV-2 virus is close to SARS-CoV  (90%) and among their similarities, the presence of the spike protein (S) but also the ORF8 gene encoding protein 8 (which I call ORF8).

One could therefore assume that mutations and then the suppression of this part of the genome of SARS CoV-2, could explain the phenomenon of acceleration and regression of this epidemic disease, with an increasingly less virulent expression of the disease Covid-19, until its complete disappearance.

Discovery of a deletion of 382 nucleotides during the early evolution of SARS-CoV-2 (reference 6).

Discovery of a deletion of 382 nucleotides during the early evolution of SARS-CoV-2 (reference 6).


Has this type of mutation ever been observed for SARS-CoV-2?

Although mutations are weak in the region where genes are encoding ORF proteins in SARS CoV-2's genome, 13 variation sites have been identified by one research team, and among them, two sites (one in ORF8 and one in ORF1a) have shown high mutation rates (of around 30%).

In another pre-print article of March 12th, 2020, a Chinese team found a specific mutation on the viruses of eight patients hospitalized in Singapore. Indeed, the genome of SARS-CoV-2 that had contaminated them had a deletion of 382 nucleotides containing, among other things, the ORF8 gene, which is encoding the protein that intervenes in the replication of the virus.

They realized that the viruses, with this deletion, had been circulating since at least mid-February 2020. This may explain why the epidemic would have been better contained in Singapore and this part of the world, and not just through better pandemic management.

Is the key to the decline in contagiousness hidden in the area of the genome containing the ORF8 gene?

These results show that there may be selective mutations in SARS-CoV-2. Similar data on SARS-CoV, had suggested that the genetic variation in the region of the ORF8 gene was the result of viral adaptation.

In addition, in vivo studies in animals that have been inoculated with SARS-CoV have shown that the presence of the ORF8 gene induces higher average body temperature and stronger antibody responses than when it was absent, suggesting that the presence of the ORF8 gene (native or mutated) in humans may lead to a stronger immune response than in its absence.

In light of these different results, it would be interesting to sequence the genomes of the Covid-19 virus strains that have infected the latest patients to see if the region containing ORF8 has mutated or disappeared. This would eventually determine at what stage of the pandemic we are and validate the hypothesis that the pandemic curve would follow the evolution of the ORF8 gene.  

Further studies will be needed to validate the correlation between the evolution of this gene mutations and the increase then the decrease in contagiousness. If this is the case, this gene could serve as an indicator for future pandemics. One drug path could be to target this ORF8 protein to render it inactive or prevent it from being translated from the ORF8 gene.

In the meantime, there is a good chance that a mechanism of this nature might be happening.

When from the trench, you see the enemy withdrawing you have not yet won the war, but something happens.

Massimo Clementi, Director of the Laboratory of Microbiology and Virology at IRCCS Hospital San Raffaele in Milan

Is there a decrease in contagiousness and a reduction in symptoms?

As far as contagiousness is concerned, this seems to be the case, if we refer to the number of new infections in areas where people have been least contained in France. This is especially true in the northen subburbs of Paris region where an outbreak increase could have been expected. However, the numbers do not seem to have grown exponentially.

For the mitigation of symptoms, we will take a little tour on Italian side and the testimony of Massimo Clementi, bearing good news. Clementi is director of the Laboratory of Microbiology and Virology of the IRCCS Hospital San Raffaele in Milan, he has been interviewed by the daily quotidiano.net.

According to him, the profile of the infection is changing, compared to the first days of the tsunami. "When from the trench, you see the enemy withdrawing you have not yet won the war, but something is happening".

In March, intensive care units were full of patients arriving at the emergencies with respiratory failure requiring ventilation. We've seen a lot of deaths. Now, these situations are increasingly rare, as confirmed by the Civil Protection data."

In the US, the virus would travel from east to west, from coast to coast, while it would lose virulence during its mutations. For example, in Washington state in the western United States, where the epidemic occurred later, the strains would be less virulent.

It would appear that mutations and deletions in the area where the ORF8 gene is located may explain the phenomenon of acceleration and regression of this epidemic disease, as Professor Raoult suggested in his explanation of how epidemic diseases work. "The end of the game" would therefore be on track.

We now have good reason to hope and see the future in a more positive way, with the return to a life where joy can finally regain its full place.

But in the meantime, caution is advised. Continue to respect barrier gestures (frequent hand washing with soap or an alcohol-based solution, sneezing into your elbow or into a disposable tissue), wearing a mask and social distancing mesures because until we have scientific proof that the virus has indeed mutated to a benign form, we will have to maintain our vigilance.

Take care,

M. E. DAVID

 

#covid19 #actucovid19 #genomecovid19 #mutationscovid19 #finpandemiecovid19 #geneORF8covid19

#lecovid19pourlesintelligentsquisignorent

BIBLIOGRAPHY :

https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463 https://www.radhttps://www.quotidiano.net/salute/coronavirus-news-1.5139665?fbclid=IwAR1_xCC_wsmkopZ7emndtLTo_EEzhpyUaA2pdOJSvsBnsyIRaQdIhfxnPCkioclassique.fr/magazine/articles/coronavirus-cest-en-train-de-seteindre-assure-didier-raoult/ https://www.gisaid.org/ https://www.nytimes.com/2020/04/08/science/new-york-coronavirus-cases-europe-genomes.html?fbclid=IwAR2TZDOzAs_2pv-FEfN2OrbaH29NWEJPA9GSMFZc4vM8tIjh55YJmEezeYs https://www.pourlascience.fr/sd/genetique/les-routes-du-covid-19-revelees-par-les-genes-19009.php https://www.researchgate.net/publication/339904520_Discovery_of_a_382-nt_deletion_during_the_early_evolution_of_SARS-CoV-2?fbclid=IwAR1hxpRdYIsRRZzxgEexABwG70FvM9nSM3HdsGwkY_8UQdmSWPtAos7eNjo https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7161481/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32167180 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7176222/ https://www.quotidiano.net/salute/coronavirus-news-1.5139665?fbclid=IwAR1_xCC_wsmkopZ7emndtLTo_EEzhpyUaA2pdOJSvsBnsyIRaQdIhfxnPCk https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7176222/#CR47_12 https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/

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Publié le par M. E. DAVID
Publié dans : #genomecovid19, #mutationscovid19, #findepandemiecovid19, #geneORF8covid19
« Les épidémies commencent en devenant de plus en plus contagieuses, de plus en plus graves. Puis petit à petit, elles le sont de moins en moins"

« Les épidémies commencent en devenant de plus en plus contagieuses, de plus en plus graves. Puis petit à petit, elles le sont de moins en moins"

Aujourd'hui, c'est jour de déconfinement, malheureusement après ces belles journées ensoleillées, nous voilà à nouveau dans la grisaille et sous la pluie pour beaucoup d'entre nous. C'est un peu comme si le temps s'était mis au diapason de l'humeur des Français, entre stress et angoisse avec cette rentrée sur fond de crise sanitaire. 

Je n'ai pas de boule de cristal, mais les dernières études des données de nouveaux cas, de personnes hospitalisées etc, sont plutôt porteuses d'espoir, évidemment, on ne pourra pas échapper à quelques clusters (ensemble de personnes contaminées à partir d'un individu porteur) car le virus circule encore mais tout est mis en place pour tester et isoler les personnes porteuses du covid19 donc nous pouvons retrouver une vie plus sereine.

Ce mardi 05 mai, sur Radio Classique, le Professeur Raoult interviewé par Guillaume Durand, a confirmé que nous approchions de la fin de la pandémie.

L'épidémie mondiale de covid19, selon lui, se présente sous la forme d'une courbe en cloche qui est une forme banale pour les courbes de la plupart des infections respiratoires transmissibles.

Toutes les courbes de nouveaux cas, qu'elles soient en France, en Europe ou dans le reste du monde ont sensiblement la même forme, avec ou sans confinement.

Le professeur Didier Raoult, éminent infectiologue, a noté que le nombre de personnes contaminées se présentant à l'IHU de Marseille (Institut Hospitalo-Universitaire), diminue comme en France et dans le reste du monde. La deuxième vague lui paraît donc improbable car les données ne vont pas dans ce sens. Tous les instituts à travers le monde observent la même décroissance avec ce type de courbes en cloche.  

D'après lui « Pour des raisons que personne ne comprend, les maladies épidémiques sont comme ça, elles commencent, elles deviennent de plus en plus contagieuses, elles deviennent de plus en plus graves et puis petit à petit, elles diminuent et elles sont de moins en moins contagieuses". C'est, semble-t-il, ce qui se vérifie pour la plupart des épidémies. 

Il a remarqué que le virus est actuellement moins contagieux et que le risque de contamination secondaire est donc désormais beaucoup plus faible qu'il y a un mois.

Alors allons vérifier cette hypothèse avec les dernières données scientifiques et médicales disponibles.

Le virus est moins contagieux maintenant que ce qu'il était il y a un mois.

Le Professeur Didier Raoult sur radio classique, l'invité politique

https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/

https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/

Pour comprendre ce phénomène, nous allons nous intéresser à l'analyse des mutations observées et à leurs conséquences au niveau de l'expression du virus en corrélation avec les symptômes observés.

Pour ceux qui le souhaitent et pour mieux comprendre de quoi je vais parler, je vous invite à lire ou relire au préalable mon article sur le covid 19 et ses mutationsComme je vous l'avais mentionné dans cet article, les coronavirus mutent régulièrement. Ces mutations se font à une fréquence moindre que pour les virus de la grippe mais suffisante pour voir apparaître de nombreux mutants.

Depuis que le premier génome du covid19 a été décodé, 17000 autres génomes ont été séquencés à ce jour et partagés sur le site GISAID dont certains portent des mutations distinctives. Il peut aussi arriver que lors de ses mutations certains accidents arrivent, comme des pertes de certaines parties du génome ou plus rare, des ajouts

Dès le mois d'avril, 33 souches distinctes pouvaient être dénombrées avec des caractéristiques légèrement différentes par rapport à la souche ancestrale. Des scientifiques, avait observé, qu'un des mutants avait acquis la capacité de produire une charge virale 270 fois supérieure à la souche classique. D'autres équipes ont trouvé des délétions (perte d'une partie du génome) sur d'autres souches de virus SARS-CoV-2.

 

Il y a-t-il eu la phase d'augmentation de la contagiosité et de la gravité du virus ?

Nous avons malheureusement constaté l'augmentation de la contagiosité et de la gravité des symptômes du virus lorsque la vague a frappé de plein fouet les pays européens et New York.

Comment expliquer que les cas les plus graves auraient été observés en Europe et à New York ?

  • Les souches qui ont attaqué les new-yorkais provenaient en grande partie d'Europe

Nous avons observé une attaque plus meurtrière du virus en Europe et New-York par rapport aux pays asiatiques, touchés les premiers. Dans un article du New York Times, deux groupes de chercheurs distincts, ayant travaillé sur les génomes en sont venus aux mêmes conclusions, que la plupart des cas de coronavirus de New York sont bien venus d'Europe où l'épidémie touchait sévèrement les populations du vieux continent. 

  •  Des souches plus agressives et aptes à se propager plus vite 

Les analyses génétiques des populations de 103 génomes du SARS-CoV-2 ont indiqué que ces virus ont évolué en deux types principaux (désignés L et S). La forme S, la version ancestrale représentait 30% des génomes étudiés alors que la souche du type L représentait environ 70%. Les scientifiques concluaient que l'intervention humaine avait pu exercer une pression sélective plus sévère sur le type L, le rendant plus agressif et apte à se propager plus vite.

Une autre étude a montré que la plupart des sous-souches dont les mutations se situaient sur les gènes ORF8 et ORF1a (codant pour deux protéines) se trouvaient sur des patients à l'extérieur de Wuhan.

Pour rappel, il y a dans nos cellules des petits systèmes capables de traduire les messages contenus dans notre matériel génétique et de produire des protéines qui sont des assemblages de petites unités que l'on appelle "acides aminés".

Les européens et les new-yorkais auraient donc eu des souches plus virulentes que celles circulant au début de l'épidémie en Chine.

Que savons nous de la précédente épidémie de SRAS ?  

En 2003, lors de l'épidémie de SRAS (avec le virus SARS-CoV), on a pu observer une courbe en cloche avec une accélération et une régression comme le mentionnait le professeur Raoult.

Au cours de la progression de cette épidémie, on a constaté dans la population humaine, l'apparition d'un certain nombre de variantes génétiques, du fait des mutations génétiques inévitables.  

Une grande proportion de ces virus présentait des mutations ou des suppressions de matériel génétique au niveau du gène codant pour la protéine "ORF8". Et ces mutations ou délétions étaient associées à une aptitude réduite du virus à se répliquer.

Vers la fin de l'épidémie de SRAS, en 2003, les séquences des génomes provenant des virus prélevés sur les derniers patients contaminés, étaient exempts du gène codant pour "ORF8", ce dernier ayant été supprimé du matériel génétique du virus d'origine. Cette suppression pouvant être associée à une forme d'adaptation à l'hôte. 

Le même type de phénomène a aussi été observé pour les virus SARS-CoV de chauves souris, avec une disparition similaire de cette fraction du génome codant pour la protéine "ORF8".

Dans une étude chinoise, menée sur 63 échantillons (isolats) de SARS-CoV, les chercheurs ont noté des variations majeures dans la région du génome viral où se situe le gène ORF8 et ont d'autre part observé une corrélation entre les différentes phases de l'épidémie et les différentes variations constatées dans cette région du génome. 

Ils identifiaient 3 phases.

La phase précoce : la période de première apparition du SRAS où le gène ORF8 était présent.

La phase intermédiaire où ont été observées des mutations ou des délétions de séquences de nucléotides plus ou moins longues, dans la zone du gène ORF8.

Et la phase tardive où le gène ORF8 avait complètement disparu du génome, ce qui semble avoir signé la fin de l'épidémie de SRAS due au SARS-CoV.

Lors de cette épidémie de SRAS chez l'homme, la suppression d'un fragment du génome de 29 nucléotides de la région ORF8 semble s'être produite rapidement. On a aussi noté sur plusieurs mutants issus de patients de Hong Kong, une délétion de 386 nucléotides dans cette même région du génome, chez certains patients. 

Le virus SARS-CoV-2 est proche du SARS-CoV (90%) et parmi leurs similitudes, la présence de la protéine spike (S) mais aussi le gène ORF8 codant pour la protéine 8 (que j'appellerai ORF8).

On pourrait donc émettre l'hypothèse que les mutations puis la suppression de cette partie du génome du SARS-CoV-2, puisse expliquer le phénomène d'accélération puis de régression de cette maladie épidémique, avec une expression de moins en moins virulente de la maladie Covid-19, jusqu'à sa disparition complète.

Découverte d'une délétion de 382 nucléotides au cours de l'évolution précoce du SARS-CoV-2 (référence n°6)

Découverte d'une délétion de 382 nucléotides au cours de l'évolution précoce du SARS-CoV-2 (référence n°6)

Ce type de mutation a-t-il déjà été observé pour le SARS-CoV-2 ? 

Une équipe a observé sur le SARS-CoV-2 que, bien que les mutations soient faibles dans la région du génome où l'on retrouve les gènes codant pour les protéines ORF,13 sites de variation ont été identifiés, dont deux (un dans ORF8 et l'autre dans ORF1a) qui ont montré des taux de mutation de l'ordre de 30%

Dans un autre article en pré-impression du 12 mars 2020, une équipe chinoise a constaté une mutation particulière sur les virus de huit patients hospitalisés à Singapour. En effet le génome du SARS-CoV-2 qui les avait contaminés présentait une délétion (suppression) d'un enchaînement de 382 nucléotides contenant, entre autre, le gène ORF8 codant pour la protéine qui intervient dans la réplication du virus. 

Ils se sont rendu compte que les virus, dépourvus de cette séquence génomique, circulaient depuis au moins la mi-février 2020. Ce qui pourrait expliquer pourquoi l'épidémie aurait été mieux contenue à Singapour et dans cette région du monde, et pas uniquement grâce à une meilleure gestion de la pandémie. 

La clef de la baisse de contagiosité serait-elle cachée dans la zone du génome contenant le gène ORF8 ?

Ces résultats montrent qu'il peut y avoir des mutations sélectives dans le SARS-CoV-2. Des données similaires sur le SARS-CoV, avaient laissés les scientifiques supposer que la variation génétique dans la région du gène ORF8 était le résultat d'une adaptation virale.

De plus, des études in vivo, sur des animaux auxquels on a inoculé le SARS-CoV ont montré que la présence du gène ORF8 induisait une température corporelle moyenne plus élevée et des réponses en anticorps plus fortes, que lorsqu'il était absent, suggérant que la présence du gène ORF8 (natif ou muté), chez l'homme pouvait conduire à une réponse immunitaire plus forte, qu'en son absence.

Au vu de ces différents résultats, il serait intéressant de séquencer les génomes des souches de virus Covid-19 ayant contaminé les derniers patients afin de vérifier si la région contenant le ORF8 a muté ou a disparu. Cela permettrait éventuellement de déterminer à quel stade nous en sommes de la pandémie et de valider l'hypothèse selon laquelle la courbe de la pandémie suivrait l'évolution et le devenir du gène ORF8.  

Des études complémentaires devront valider la corrélation entre la présence ou non de ce gène et la baisse de la contagiosité. Si tel est le cas, ce gène pourrait servir d'indicateur pour d'éventuelles pandémies à venir. Une des pistes de médicaments pourrait être de cibler cette protéine ORF8 afin de la rendre inactive ou d'empêcher qu'elle puisse être traduite à partir du gène ORF8. 

En attendant, on a de bonne chance de penser que c'est un mécanisme de cet ordre qui semble se produire.

Lorsque de la tranchée, vous voyez l’ennemi qui se retire vous n’avez pas encore gagné la guerre, mais quelque chose se passe.

Massimo Clementi, directeur du Laboratoire de Microbiologie et Virologie de l’IRCCS Hôpital San Raffaele de Milan 

Il y a t-il une baisse de la contagiosité et une atténuation des symptômes ?

Pour ce qui est de la contagiosité, cela semble être le cas, si l'on se réfère aux nombres de nouvelles contaminations dans les zones où les personnes se sont le moins confinées en France. Ceci est plus particulièrement vrai en région parisienne où l'on aurait pu s'attendre à une flambée de l'épidémie. Or les chiffres ne semblent pas croître de manière exponentielle.

Pour l'atténuation des symptômes, on va faire un petit tour du côté de l'Italie avec de bonnes nouvelles et le témoignage de Massimo Clementi, directeur du Laboratoire de Microbiologie et Virologie de l’IRCCS Hôpital San Raffaele de Milan pour le quotidien quotidiano.net.

D'après lui, le profil de l’infection est en train de changer, par rapport aux premiers jours du tsunami. "Lorsque de la tranchée, vous voyez l’ennemi qui se retire vous n’avez pas encore gagné la guerre, mais quelque chose se passe".

En mars, les unités de soins intensifs étaient pleines de patients qui arrivaient aux urgences avec une insuffisance respiratoire nécessitant une ventilation. Nous avons vu beaucoup de morts. Maintenant, ces situations sont de plus en plus rares, comme le confirment les données de la Protection Civile". 

Aux USA, le virus voyagerait d'est en ouest, d'un océan à l'autre, tandis qu'il perdrait en virulence, au cours de ses mutations. Par exemple dans l'état de Washington, dans l'ouest des Etats Unis, où l'épidémie est arrivée plus tardivement, les souches seraient moins virulentes.

Il semblerait que les mutations et les délétions de la région du génome où se trouve le gène ORF8, puissent expliquer le phénomène d'accélération puis de régression de cette maladie épidémique, comme le suggérait le Professeur Raoult, dans son explication sur le fonctionnement des maladies épidémiques. "La fin de partie" serait donc en bonne voie.

Nous avons maintenant de bonnes raisons d'espérer et de voir l'avenir de manière plus positive, avec le retour à une vie où la gaieté pourra enfin retrouver toute sa place.

Mais en attendant, la prudence est de mise, continuez à bien respecter les gestes barrières, le port du masque et la distanciation sociale car tant qu'on n'aura pas la preuve scientifique que le virus a bel et bien muté vers une forme bénigne, il faudra maintenir notre vigilance.   

Take care,

M. E. DAVID

 

#covid19 #actucovid19 #genomecovid19 #mutationscovid19 #finpandemiecovid19 #geneORF8covid19

#lecovid19pourlesintelligentsquisignorent 

BIBLIOGRAPHIE

https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463 https://www.radhttps://www.quotidiano.net/salute/coronavirus-news-1.5139665?fbclid=IwAR1_xCC_wsmkopZ7emndtLTo_EEzhpyUaA2pdOJSvsBnsyIRaQdIhfxnPCkioclassique.fr/magazine/articles/coronavirus-cest-en-train-de-seteindre-assure-didier-raoult/ https://www.gisaid.org/ https://www.nytimes.com/2020/04/08/science/new-york-coronavirus-cases-europe-genomes.html?fbclid=IwAR2TZDOzAs_2pv-FEfN2OrbaH29NWEJPA9GSMFZc4vM8tIjh55YJmEezeYs https://www.pourlascience.fr/sd/genetique/les-routes-du-covid-19-revelees-par-les-genes-19009.php https://www.researchgate.net/publication/339904520_Discovery_of_a_382-nt_deletion_during_the_early_evolution_of_SARS-CoV-2?fbclid=IwAR1hxpRdYIsRRZzxgEexABwG70FvM9nSM3HdsGwkY_8UQdmSWPtAos7eNjo https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7161481/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32167180 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7176222/ https://www.quotidiano.net/salute/coronavirus-news-1.5139665?fbclid=IwAR1_xCC_wsmkopZ7emndtLTo_EEzhpyUaA2pdOJSvsBnsyIRaQdIhfxnPCk https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7176222/#CR47_12 https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/

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La saga du Professeur Raoult et de son protocole à base d'hydroxychloroquine

#19/05/2020

Interview du professeur Didier Raoult du 19/05/2020

Comparaison des courbes épidémiques selon les villes et les pays.

Bulletin d'information scientifique de l'IHU - Nous avons le droit d'être intelligents ! Pr Didier Raoult, Directeur de l'IHU Méditerranée Infection

https://www.youtube.com/watch?v=Sc1-JBX2y70

 

#14/05/2020

Interview du professeur Didier Raoult sur i24NEWS le 14/05/2020

Un visionnaire, une icône, un épidémiologiste de renommée mondiale qui a l'oreille des grands de ce monde mais qui a beaucoup d'ennemis.

Les meilleurs résultats de son traitement HQC + Azithromycine avec sa série.

"Les chiffres infléchissent, l'histoire est en train de vous donner raison, l'épidémie est en train de disparaître." 

Beaucoup de décideurs se sont positionnés comme s'ils étaient face à une maladie chronique, à réfléchir à la mise en place d'études pour valider quel traitement sera le plus efficace alors que la pandémie sera finie quand les résultats seront enfin disponibles.  Rôle de médecin de terrain avant tout, avec la prise en charge des malades. 

Repositionnement des molécules anciennes controversé car ne rapporte pas suffisamment à l'industrie pharmaceutique. Comment développer une molécule qui n'est plus rentable ?  

Un capital de molécules qui peuvent être utilisées comme azythromycine sur le Zika. On scie une branche de la science qui s'est développée depuis 20 ans et ce n'est pas vu de manière favorable. 

HCQ effet connu sur les autres maladies infectieuses respiratoires. 

Les média traditionnels (journaux et télévision) en conflit total avec les réseaux sociaux et youtube. Les média traditionnels identifient comme fake news des informations qui sont réelles et ils ne relayent pas plus de fausses informations que les réseaux sociaux. 

Lésions et séquelles chez les patients faiblement symptomatiques ou sans symptômes. Cela a aussi été étudié dans les deux autres épidémies de coronavirus. Il existe une discordance entre l'état clinique au départ et l'état des lésions des poumons. Risque d'évolution vers fibroses respiratoires (scanner à base dose). Il faut définir qui devrait pouvoir être diagnostiqué. Plan pour détecter les patients atteints afin de prévenir l'évolution des séquelles au niveau pulmonaire vers une fibrose. Il est possible de traiter si l'on intervient tôt.   

Pas de portage chronique du virus chez l'homme. Le virus peut circuler autour de la terre puis revenir, on pourrait peut être avoir des cas secondaires provenant d'Inde qui a eu un début d'épidémie décalé. Cette épidémie pourrait devenir saisonnière. On ne peut pas savoir.

C'est une maladie aiguë et immunisante car il y a une production d'anticorps.

"Bizarrement les gens qui vont mal ont beaucoup d'anticorps. Beaucoup plus tôt et en grande quantité. Ce serait donc pour ça que les traitements antiviraux programmés dans les dernières phases de la maladie ne seraient pas efficaces. Dans la phase finale de la maladie, le problème n'est plus lié au virus mais à la réponse immunitaire qui est très forte, violente (ndlr et disproportionnée)."  

La meilleure manière de lutter contre la transmission d'une infection respiratoire est avant tout lié au lavage des mains. Pour lui les masques sont indispensables pour le personnel soignant. C'est le lavage des mains qui prévient la maladie et protège de la contamination.

https://www.youtube.com/watch?v=yqxvhbciPQ8

#12/05/2020

Interview du professeur Didier Raoult : Quelles leçons doit-on tirer de l'épidémie ?

- Des chiffres qui confirment la fin de l'épidémie.

- Réflexions sur la gestion de la crise et des stratégies thérapeutiques.

- Epidémie avec un virus que l'on ne connaissait pas et une maladie différente de celles observées jusqu'à présent.

- Plan pour détecter les patients atteints de séquelles au niveau des poumons (fibroses).  

 

Bulletin d'information scientifique de l'IHU - Nous avons le droit d'être intelligents ! Pr Didier Raoult, Directeur de l'IHU Méditerranée Infection

https://www.youtube.com/watch?v=nGPaQsh_rVM&fbclid=IwAR2wxJ5dJ1wyMf6vQ_iCy-fG8P-YdP6T_DIBsiF4mGMeiRnG4aH7vLW98tI

 

#11/05/2020

Interview du professeur Didier Raoult par Guillaume Durand sur Radio classique dans sa matinale du 05/05/2020

https://data.radioclassique.fr/Podcasts/Invite_Politique_du_05-05-2020_08h18.mp3

 

#01/05/2020

Des médecins américains affirment que l'hydroxychloroquine, médicament controversé aux USA et mis en lumière par Trump, aide 91% des patients atteints de coronavirus en facilitant leur récupération et en améliorant leurs chances de survie. Ils soutiennent qu'il ne faudrait pas attendre les données des "essais cliniques" vu les résultats largement positifs obtenus sur 2333 patients.  dailymail.co.uk

https://www.dailymail.co.uk/health/article-8266737/Doctors-group-claims-hydroxychloroquine-helps-91-coronavirus-patients.html?ito=facebook_share_fbia-top&fbclid=IwAR3_ih6HG02YM8TZoY8GHNGwzdaVwDbFTGlOVOfvjL-x1Fq2z9eTbARz1aA

 

#30/04/2020

Ci-joint le lien pour aller voir l'excellente interview du professeur dans son intégralité. 

Des informations très pertinentes. A voir absolument. 

https://www.bfmtv.com/mediaplayer/video/didier-raoult-parle-sur-bfmtv-revoir-l-entretien-en-integralite-1243716.html

 

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L'origine du COVID19 naturelle ou pas ? Que l'enquête commence...

Le professeur Luc Montagnier, prix Nobel de Médecine pour ses découvertes sur le virus du Sida, a lancé, il y a quelques jours un pavé dans la mare, qui a fait l'effet d'une bombe au niveau de la communauté scientifique quant à l'origine du virus et l'éventualité et l'éventualité qu'il puisse être issu d'une manipulation génétique.

Sa théorie selon laquelle il serait le produit de la manipulation d'un coronavirus auquel on aurait ajouté une séquence provenant du VIH, est venue relancer la thèse, largement relayée sur les réseaux sociaux, selon laquelle le virus aurait été créé dans un laboratoire P4 et qu'il s'en serait échappé par accident ou qu'il aurait été libéré intentionnellement. 

Image par Arek Socha de Pixabay

Dès le mois de mars nous avions eu des informations comme quoi l'origine pouvait être animale, via la chauve-souris, comme pour le SRAS CoV1. Puis le pangolin, ce petit animal en voie de disparition, dont les chinois sont friands, a, à son tour, été présenté comme un candidat potentiel. Mais l'hôte intermédiaire entre le pangolin et l'homme n'ayant pas été trouvé, les investigations se poursuivent. 

Nous allons enquêter sur ce sujet et voir comment progresse les différentes théories. Je vais vous faire une story avec une série d'articles, pour suivre, en temps réel, l'avancement des recherches et faire la lumière sur la véritable origine du covid19. 

Alors que l'enquête commence...

Take care,

M. E. DAVID

 

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